軟式內鏡進入內鏡清洗中心，清洗驗證和內鏡檢查都是非常重要的，雖然《軟式內鏡清洗消毒技術規范》對內鏡的再處理有嚴明的規定，但是因為清洗問題導致的患者院內感染事件依然常有發生。2015年3月，美國華盛頓州的嚴重的導致患者大量死亡的案例更是應該讓我們警醒。嚴格的內鏡器械的清洗，應該是做好預處理、測漏、清洗和漂洗后，再通過內鏡自動清洗消毒機清洗。

       軟式內鏡的再處理中有著許多挑戰，因為器械自身設計非常復雜，多數內鏡又長又窄，有各種精密零件和管路，手工清洗是去除內鏡表面看見的污物，不論后期的高水平消毒或滅菌工作是不是通過內鏡自動清洗消毒機進行，內鏡的手工清洗步驟都是不可缺少的。及時徹底的手工清洗都是內鏡消毒成功的關鍵和基礎，當然只通過手工清洗也是行不通的。研究表明，即使內鏡經過清洗后仍有微生物負載留在管路內，如果處理不當，可能會導致患者間出現非常高的傳染風險，因而軟式內鏡進入內鏡清洗中心后，清洗流程中注意清洗驗證和檢查。

       內鏡清洗中心的清洗流程中，一般包含目視檢查和清洗驗證過程，這是減少影響消毒或滅菌作用故障的措施，確保清洗方法的效果。醫院內鏡清洗中心的設立，其內的工作人員應該先接受相應的培訓，了解目視檢查軟式內鏡的重要性，及時發現設備自身的絕緣撕裂、膠水分離、鏡片開裂以及其它外部損壞，這項工作也是提高內鏡清洗水平的重要措施。而手工清洗步驟，因為容易受工作人員操作失誤或步驟遺漏因素影響，應該進行常規監測，具體包含每個內鏡的測試頻率以及制定用戶驗證程序，以增加內鏡的清洗安全系數。