保證消毒后的內鏡不被污染，內鏡清洗工作站的輔助設備必須使用到位，因為內窺鏡的再處理流程中，清潔和消毒雖然難度也不低，但是清洗與消毒后不當的處置和存放方式可能會導致已經處理干凈的設備再次受污染，提高患者感染的風險。內鏡清洗工作站相關的輔助設備可以做到完全的干燥，規范的運轉以及合理的存放，其中可能應用內鏡運轉車、吹干機、吹鏡柜等設備。

       軟性內窺鏡的再處理是一項非常有挑戰性的工作，通過媒體報道的各種關于內鏡處理失敗導致嚴重的大規模感染的案例即可了解。再處理流程中首先需經過手動清洗，其后使用清洗、消毒或是滅菌設備，沒有正確的遵守再處理規定可能導致患者虛弱或致命的感染，其次如上面所說，高水平消毒或滅菌后不當的處置和存放方式也可能會導致已經處理干凈的設備再次手污染。常見的，經過高水平的消毒后如未將內窺鏡完全干燥，所殘留的細菌就會快速繁殖并移生在器械上；在清洗消毒的過程中如使用了不干凈的手套或是從自動清洗消毒機拿取儀器接觸到不干凈的表面，也會使消毒程序受到威脅……針對相關問題，為了降低已消毒內窺鏡的再污染風險要注意內鏡清洗工作站的設備使用。

       首先是針對內鏡清洗工作站的相關工作人員，在清洗消毒機內移出內窺鏡時應配戴干凈的手套，同一手套不能重復使用于拿取干凈儀器，經過內鏡自動清洗消毒機的清潔后，沖洗步驟完成要做好干燥，用干凈的風清潔干燥內窺鏡管道，一般情況下內窺鏡末洗后10分鐘的風干內窺鏡管道過程就能基本滿足預防微生物繁殖的要求，而干燥步驟中為了保證空氣的潔凈可使用內鏡專用的吹干機，這類內鏡清洗工作站設備所制造的風不含液體和碳氫化合物蒸氣，空氣能過濾到0.01μm。干燥完成后的內鏡要封存在干凈的容器中運送，存儲要在專門的內鏡儲鏡柜中，內鏡清洗工作站儲鏡柜能使內窺鏡垂直吊掛，不會碰觸其它內鏡和柜壁的同時有利于管道內的水順利流出。